生殖器疱疹和包皮龟头炎症状较为相似，一般患者不容易辨别。故此将二者的症状进行一番整理描述，以便进行对比自查判断。
生殖器疱疹是由II型疱疹病毒感染所致。它通过性接触传播，是一种性病。大多在感染后3～7天发病。早期症状有局部瘙痒、灼热痛，阴茎上出现大小不等的水疱。水疱破溃后形成浅表溃疡，约7～10天左右干燥形成结痂。
同时还有全身不适、低热，头痛和腹股沟淋巴结肿大。后期病毒可侵犯尿道、膀胱，出现尿频、尿痛，甚至尿潴留。此病还可并发腰骶部神经炎和脊髓炎等。
包皮龟头炎初起时局部潮红，阴茎的皮肤发红、肿胀，自觉龟头有灼热和瘙痒的感觉。包皮和龟头可见红斑，表面光滑，并有小疱疹，红斑的边缘较清楚，逐渐扩大，呈环状，可形成浅表性溃疡面，急性发作时有糜烂、渗液。
如果是滴虫感染引起包皮龟头炎，会出现龟头丘疹和红斑，逐渐扩大，边缘清楚，红斑上可见针头大小的小水疱，最后形成糜烂面。急性浅表性包皮龟头炎继发感染后可见小溃疡，有恶臭的乳白色脓性分泌物。如与内裤磨擦即感疼痛，患者常常活动不便。可伴有腹股沟淋巴结的肿大和压痛。
临床上根据疾病引起的皮疹进行诊断。生殖器疱疹特点是有大小不一的疱疹，疱疹可有痒痛感，而其它皮肤则无症状，皮损以水疱为主，多伴疼痛。龟头包皮炎则是会影响整个龟头，连同部分包皮都有炎症的症状，如红肿，发热，疼痛，甚至有破损，流出一些液体。
