慢性肾小球肾炎发病主要与患者的自身免疫功能紊乱有关。中医扶正固本的治疗原则与人体免疫系统的关系非常密切，许多中药或方剂都有较好的调整人体免疫功能的作用，其中不少补益类中药均可增强人体的免疫功能，而有些祛邪类中药可抑制或调节人体的免疫功能，所以可以单独或配合西药一起使用可用于治疗慢性肾小球肾炎。
中医药治疗慢性肾炎的方法有：
益气固肾法用于肺肾气虚，脾肾气虚者。如黄芪、党参、太子参、生黄芪、白术、芡实、莲子肉有补气作用；金樱子、莲须、菟丝子、覆盆子有固肾作用。
温补脾肾法用于脾肾阳虚者，常用方剂有附子理中汤、真武汤等。
滋养肾阴法用于肾阴亏损者，慢性肾小球肾炎如温补脾肾过久或用激素治疗者，都可导致肾阴耗伤，常用方剂有六味地黄汤、知柏地黄汤等。
气阴两补法用于气阴两虚证，常用方剂为参芪地黄汤。
阴阳双补法用于阴阳两虚者，常用方剂为桂附地黄汤。
清热解毒法适用于慢性肾小球肾炎合并感染患者，可选用五味消毒饮合银翘散加减。
活血化瘀法慢性肾小球肾炎病程较长，多数患者都有不同程度的瘀血征象，可在辨证论治的基础上选加丹参、泽兰、红花、益母草、水蛭等。
祛风胜湿法慢性肾炎有湿胜气，脾气不升者，可用本治法，常用方剂为祛风胜湿汤。
中医药在治疗慢性肾小球肾炎上有其自身特色，而且配合化学药物治疗，在降低化学药物不良反应方面可能有一定作用，两者在疗效上可能有一定协同作用。但需要注意的是，患者应在正规医院就诊，不可盲目相信所谓的“偏方”、“秘方”，一些中草药本身也具有肾毒性，使用不当反而会加重肾脏损害。
