肛肠术后小便困难主要因：①麻醉因素。麻醉使膀胱膨胀感觉迟钝或消失，膀胱过度膨胀失去张力;②尿道括约肌痉挛。术后肛门疼痛，使肛门括约肌痉挛，由于肛门括约肌和尿道括约肌属同一神经支配，结果尿道括约肌也痉挛;③卧床后改变排尿习惯;④肛门局部或肠腔敷料填塞过多，压迫尿道。
可采用以下方法治疗：①热水袋敷小腹和肛门会阴;②人造水滴声刺激，造成条件反射，增强排尿感;③征求医生同意后松解包扎绷带;④鲜生姜或生大蒜刺激尿道口;⑤肌肉注射新斯的明0.5～1mg,或0.5%普鲁卡因10～20ml行长强穴封闭;⑥在脐下四横指腹部正中线，用指尖垂直向下按压片刻，当产生尿意感时即去排尿;⑦500ml生理盐水灌肠，松驰肛门而使尿道括约肌也松弛;⑧膀胱过度充盈，采用导尿。术后第一次小便排出后，如仍感小便不畅，可通过口服中药八正散或车前子少量代茶饮来治疗。
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肛瘘的外用药物主要有以下几类：第一，坐浴的药物，比如说皮肤康洗液、苯扎氯铵溶液、高锰酸钾，这类药物有消肿、止疼、止痒的功效，对于肛瘘的炎性期，有非常好的治疗效果。第二，抗生素类，比如说头孢类抗生素或者硝基咪唑类抗生素，对于肛瘘的炎性发作，有积极的抗感染作用，可以减轻肛瘘的症状，比如说肿胀、疼痛、流脓。第三，对症处理瘙痒的药物，临床上主要应用是含有糖皮质激素的药膏，比如说皮炎平、尤卓尔、派瑞松等等。以上方案仅供参考，具体药品使用请结合自身情况在专业医生指导下用药。
高位肛瘘，通常由于慢性炎症刺激，会引起肛管直肠环纤维化，或瘘管围绕肛管形成半环状纤维条索，影响肛门括约肌收缩，而出现排大便不通畅。低位肛瘘通常不会影响排大便，有时表现为分泌物刺激肛周皮肤，引起瘙痒等症状。肛瘘分为高位以及低位，瘘管主管在肛提肌以上，呈环形或半环形的称为高位马蹄形肛瘘，如果肛瘘瘘管在肛提肌以下，称为低位肛瘘。
高位肛瘘和低位肛瘘的区别在于瘘管在括约肌的位置进行判断。高位肛瘘和低位肛瘘的区别在于瘘管在括约肌的位置进行判断。低位肛瘘是指距肛门位置很近的肛瘘，而高位肛瘘是指离肛门位置很远的肛瘘，这两种肛瘘的治疗方法不尽相同，其中，低位肛瘘主要是行外口和瘘管的切开，将坏死的组织剔除，再配合饮食的调整，慢慢规律换药，再配合以药物坐浴治疗即可。
