90%以上男性病人的尿道分泌物作革兰氏染色涂片可迅速找到淋球菌，而女性阴道分泌物革兰氏染色检查的敏感性仅约60%。直肠受累时作直肠镜检查可见肠壁上有粘液脓性分泌物。所有的女性，以及尿道分泌物革兰氏染色检查阴性或结果可疑的男性，应作生殖道分泌物培养或遗传学鉴定。有咽或直肠感染症状的男性和女性，均应作培养或遗传学诊断，因为革兰氏染色的敏感性及特异性均较差。培养时，应将取自尿道，子宫颈，直肠和其他感染部位的渗出物接种到适宜的培养基(如改良的Thayer-Martin培养基)，在35~36℃温度，含有3%~10%CO2的大气中(可用蜡烛缸)孵育48小时。24小时后已可见某些菌落；大多数在48小时出现。若当时无足够的实验设施，可将标本接种到可输送的培养基上运送到实验室，在48小时内，最好在24小时内，作次代培养。
以基因探针为基础的能可靠而快速检测淋球菌RNA的诊断试验可结合检测衣原体的试验，以过筛淋球菌和衣原体所致的尿道炎或子宫颈炎。在此同时以及3个月后应作梅毒血清学试验(STS)，并且还应彻底检查病人以排除其他性传病。
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淋病的确诊有以下几个步骤： 1.首先需要病人的性接触史，病人有没有不洁的性交史，性乱史，双性史等，和一些密切的性行为， 2.再一个就是典型的临床表现，就是出现泌尿生殖系统的炎症反应，男性出现尿道的尿急，尿痛，尿频和尿脓，女性病人尿道炎症状和宫颈炎的症状，这时候她的外阴会有大量的白带，白带分泌的增多， 3.化验室检查，我们通过给取病人的分泌物进行染色，显微镜观察，发现淋病双球菌，然后通过培养来确定淋病双球菌，这时候我们就可以确定病人是否患有淋病，是确定病人患有淋病的一个不可或缺的步骤。
淋球菌感染以后，往往大部分病人发展成淋病，也就是说男性患者有泌尿生殖系统的症状。 也就是临床上常说的尿急，尿频，尿痛，尿脓的出现，女性患者可以出现这些症状，还有宫颈炎的症状，但是也有很少的一部分人可能没有出现这么典型的临床表现，通常我们叫做隐性感染者，也叫做他带菌者，往往这种没有症状的带菌者，在他的泌尿生殖系统和宫颈的部位含有大量的淋球菌，使他成为一个传染源，如果他跟别人发生性关系，就可以造成病人的淋病感染，所以说隐性带菌者是一个非常重要的传染源。
在我们国家传染病防治法当中，分为甲类传染病，乙类传染病，丙类传染病，淋病在性病当中属于乙类传染病，是需要法定上报的传染病。 我们目前法定上报的传染病包括梅毒，淋病，艾滋病等，但是根据我们国家的情况，制定了性病传染病报告制度，目前主要是梅毒，淋病，艾滋病，尖锐湿疣，生殖器疱疹等，作为我们性病的法定上报的疾病，临床医生发现病人患有这几种传染病的时候，就要进行上报。
