患了性病淋巴肉芽肿后，主要表现为腹股沟淋巴结肿胀、化脓，发展至晚期，可以产生许多严重的并发症。其中以直肠狭窄最为多见，尤其是女性。假如病变发生在尿道，可伴发尿道狭窄；若发生在阴道，可造成阴道狭窄，还可发生阴道与直肠之间因穿孔而形成的通道（医学上叫瘘道）及外阴毁损等严重破坏性损害。缺损的生殖器还可发生癌变。性病淋巴肉芽肿并非一开始就出现这些严重的病变，在临床上，按疾病的发展过程可分为早期（感染、原发损害和皮肤损害）、中期（淋巴管播散、伴发全身症状）和晚期。
(1)潜伏期1—4周，一般在1周左右。
(2)早期症状男性患者约1/3—1/2有原发损害。初为极小的疱疹、水疱或溃疡糜烂。男性多发于阴茎体、龟头、冠状沟、包皮和尿道内。女性则发生于前庭、阴唇系带、小阴唇、阴道口及尿道口周围。皮损常为单个，有时数个，边缘整齐，围有红晕，无明显症状，不痛、不痒，常被忽略，持续1—3周自愈，不留疤痕。同性恋者或性欲倒错者可表现为出血性直肠炎(脓性分泌物和填肠}出血)。直接检查可见直肠黏膜发炎、充血、局限性剥脱或肉芽组织，可导致直肠周围脓肿、直肠阴道瘘和直肠狭窄。
(3)中期症状为腹股沟淋巴结炎。初疮出现1～4周后，腹股沟淋巴结出现肿大，约2/3的病例为单侧性，另1/3为双侧性，称为“第四性病性横痃”。淋巴结初起孤立散在，质硬性增大，有疼痛或压痛，之后常相互粘连成块状，呈浸润性，皮肤表面呈红色、紫色、紫红色和青色。由于腹股沟韧带将肿大的淋巴结分开，皮肤有皱褶，沿腹股沟呈腊肠样排列，随着疾病的进展呈现槽沟状肿大。数周后肿大的淋巴结呈现波动感，约2/3的结节在经1～2周后软化破溃，排出淡黄色浆液或血性脓液分泌物，形成多数瘘管，似“喷水壶状”，经数周或数月后而痊愈，愈后留有疤痕。约1/4的结节不破溃，于8—12周内可自然吸收，少数结节成为持久性硬化性团块。男性患者亦可累及股淋巴结和髂淋巴结，女性尚可累及髂和直肠周围淋巴结。女性很少发生淋巴结炎，因其初疮常发生于阴道下部，如经髂及肛门直肠淋巴结引流，引起髂及直肠周围淋巴结炎及直肠炎，导致腹痛和腰背痛。阴蒂和阴唇病变可与腹股沟淋巴结交通。有变态性行为者可累及其他部位淋巴结，如与感染者有口腔生殖器性行为，可发生颌淋巴结肿大，颇易考虑为淋巴瘤或何杰金氏病。出现淋巴结炎时可伴有轻重不等的全身症状，如发热、头痛、关节痛、肝脾肿大等，有时可出现皮疹，如多形红斑、结节性红斑。
在淋巴结病变发生的同时可有全身症状如发热、盗汗、周身不适、体重减轻、头痛、游走性关节痛、多关节炎、肌痛、肝和脾肿大、假性脑膜炎和结膜炎等。皮肤表现有多形红斑、结节性红斑、猩红热样皮疹、丘疹脓疱性损害和光过敏等。
