可供选择的药物：
口服一线抗结核药物 包括异烟肼、利福平、吡嗪酰胺、乙胺丁醇。
耐多药结核病病人至少已对异烟肼、利福平产生耐药性，因此可选择吡嗪酰胺、乙胺丁醇，但不能排除病人已耐药。
注射药物 包括链霉素、卡那霉素、阿米卡星(又称丁胺卡那霉素)及卷曲霉素。
由于这些药物均能产生听力下降、肾功能及前庭功能障碍等不良反应，因此只能选用其中一种药物。选用药物顺序应为链霉素、卡那霉素或丁胺卡那霉素。对前3种药物均耐药者可选用卷曲霉素。
氟喹诺酮类 包括氧氟沙星、左氧氟沙星、莫星、加替沙星。其中杀菌活性最高的是莫星，其次为左氧氟沙星、氧氟沙星。
口服二线抑菌药 包括丙(乙)硫异烟胺、对氨柳酸及环丝氨酸。
疗效尚未肯定的药物 如氯苯吩嗪、羟氨苄青霉素-棒酸复合制剂、列奈唑胺等。
治疗耐多药结核病不仅很困难(治疗严重耐多药结核病就更为困难)，而且药品价格较贵，或能产生肝、肾功能损害、胃肠道不适等多种不良反应，疗效远不如初次治肺结核、初次复治肺结核。即使按照世界卫生组织推荐的24个月长疗程方案，疗效也仅为70%左右。
治疗原则：
★确立治疗方案。根据药敏试验结果，选择至少4～5种敏感药物列入长疗程治疗方案。其中包括6个月的强化期及18个月的持续期。对痰菌仍阳性者应延长强化期，直至痰菌阴转。在未获药敏试验结果前，可根据既往治疗史及该地区耐药监测调查结果建立新的治疗方案。
★早期发现和治疗。坚持联合、规律、足量、全程的原则。坚持每日或一周6次用药。
★进行全程直接面视下督导治疗。以便使病人坚持治疗和及时发现、处理不良反应。
★定期复查痰结核菌。包括痰涂片、痰培养。结合临床表现及胸部X线改变，及时调整治疗方案。
★必要时辅以免疫治疗、手术治疗及介入治疗。
