小三阳的临床意义：小三阳意味着体内有病毒的存在，但自身的免疫功能具有控制病毒不在体内大量复制的能力，因此传染性也相对的较弱。但是人体免疫力长期处于战斗状态又没有足够消灭病毒的免疫力会导致免疫功能紊乱易形成细胞突变（肝癌）。在自身免疫力低下时，病毒也会大量复制（向大三阳转换使病情加重），当自身免疫功能获得提高时也可能会自然转阴。
小三阳治疗原则：选择个性化治疗方案；一般勿须抗病毒治疗、提高患者自身固有的抗病毒能力彻底清除体内病毒，对HBV-DNA阴性者打破免疫耐受是小三阳治疗转阴的关键。
小三阳的治疗动态：过去临床医务工作者对无症状小三阳病毒携带者，一般不给予治疗。不给予治疗的原因是认为大多数小三阳病毒携带无症状又无特效药，所以不给予治疗。对小三阳不给予治疗的错误观念持续到日本学者对无症状小三阳病毒携带者、肝穿刺活检发现：90%的无症状小三阳病毒携带者有慢性炎症并有肝纤化趋势。
上述的发现使人类对乙肝的治疗有了新的认识并遂步达成共识；认为只要体内有病毒就有不同程度的传染和不同程度的肝损坏，不能让就医者等待有了症状才进行治疗，应把病情控制在盟芽之中。在治疗的过程中切不可认为吃的药越多效果就越好，选择副作用小或无副作用的治疗方案是关键。
目前临床优化常用治疗药物多属生物制品，例如：免疫球蛋白、日达仙、胸腺肽、全息自灸贴。
