肛管直肠周围脓肿一般不能自行痊愈，如任其发展，最终脓肿将向肛周皮肤或肛管直肠腔内破溃形成肛瘘，如果脓液得到引流，症状可暂时缓解，随后破溃口可愈合，脓液又不断积聚，感染向周围继续扩散，再次出现症状，并可能出现新的脓肿，并形成多个破溃口，如此反复发作，经久不愈。
所以，一旦出现肛管直肠周围脓肿应及时治疗，少数肛周表浅的脓肿可采用抗生素治疗、热水坐浴、局部理疗等方法消散，但多数患者需要手术切开脓肿，充分引流脓液，防止其不断扩散，以减轻疼痛等症状。伴有肛瘘的肛管直肠周围脓肿，要根治必须先处理肛瘘，局部可用高锰酸钾溶液坐浴，使会阴保持清洁。同时应用抗生素控制感染，待脓肿破溃或切开引流后3个月左右，肛瘘周围炎症即会消退，纤维管道形成，再手术治疗肛瘘。
肛周脓肿的超声介入
肛周脓肿临床上较为常见，超声可以准确的诊断和有效的治疗。传统的外科手术容易形成肛瘘，超声能准确地确定肛周围脓肿的部位、大小、轮廓、形态以及与周围组织的关系，同时可以确定脓肿是否完全液化，不仅如些，超声可以准确地确定穿刺部位，进针方向和角度以及深度。从而完全、彻底、干净地引流。
（一）适应症
凡确诊为肛周脓肿而且完全液化者，均需在超声引导下彻底干净地引流脓腔。
（二）禁忌症
1、有出血倾向患者。
2、脓腔未完全液化者。继续用抗菌素，待脓肿完全液化后，再进行穿刺治疗。
3、脓腔已经机化，穿刺到脓腔内抽不出脓液者，应继续使用抗菌素。
4、直肠癌肛周围转移合并脓肿者。
5、脓肿通过窦道和多个脓腔相连者。
（三）并发症
1、菌血症、出血、血肿等，超声引导下肛周围穿刺已较少见。
2、肛瘘，外科治疗肛周脓肿此并发症常见，而超声引导下穿刺较少见。
