男性生殖道感染常引起睾丸炎、附睾炎、前列腺炎、精囊炎、尿道炎等。引起生殖道感染的病原体有淋球菌、结核杆菌、病毒、支原体、沙眼衣原体、滴虫及其他非特异性致病菌，其中以支原体和衣原体引起的生殖道感染最为常见。生殖道感染可影响精子的生成、精子活力和精子运输，造成少精症而致男子生育能力降低。生殖系结核可使精子发生抑制和运输受阻等，甚者可因睾丸炎症引起睾丸萎缩。生殖道感染还可因导致输精管道梗阻而造成无精子症。
生殖道急性感染对精子数量的影响
急性睾丸炎可由于睾丸实质广泛破坏而致睾丸生精减退或消失。附睾的急性感染可使输精管道梗阻及相邻的睾丸实质萎缩，其中附睾的这种梗阻可以是可逆性的，而后者是在急性附睾炎期间细菌侵入睾丸实质造成损害，是不可逆的，若损害严重则可表现为少精子症或无精子症。急性前列腺炎和／或精囊炎可造成射精管水肿、受压而致完全或不完全梗阻，而这类感染大多数造成梗阻是暂时性的，经抗生素治疗后可恢复通畅，因而临床上既使出现少精子症或无精子症也是一过性的。
生殖道慢性感染对精子数量及形态的影响
慢性前列腺炎很少引起射精管梗阻，但其是否可引起精子数量及形态异常还未完全定论。有人发现在精子数少于l千万／ml的病例中，生殖道感染占26％。支原体培养阳性者较阴性者的精液量多、精子数少，用强力霉素治疗后精子数增多。最近的国际性调查结果表明，生殖道感染者的精子数量、活力及形态接近正常。
精子在运输过程中形态很少发生改变，故生殖道感染对它们影响的可能性较小，但最近有人对细菌感染的精液研究结果认为，正常形态的精子百分数减低。光镜及扫描电镜观察到，在支原体存在的情况下，正常形态的精子数减少，尖头及尾部呈卷曲状、绒毛状的精子数增多，因此，有学者提出精液中精子尾部呈卷曲状或绒毛状的精子数量增多可作为诊断支原体感染的重要参数。但也有学者没有发现精液感染者的精子有形态学改变。
