大Y染色体可能会影响生育。
临床的染色体检查中，有时发现Y染色体明显比正常染色体要大叫大Y染色体，实际大Y染色体叫法是不科学的，一般叫 Y染色体的异染色区的长度增加，如Y染色体当异染色区增加后，它靠近了精子生成的基因很近，可影响基因的正常表达，就影响了精子的发育、影响精子的功能，就影响生育。
但在绝大部分情况下，大Y是染色体的多态性，95%以上是遗传的，只要是遗传的不影响生育能力，要断定大Y是自己变异的，还是遗传的，最好的办法让父亲也做个染色体检查，看看父亲的Y染色体和儿子的染色体是否相同，如不是遗传性的，那么就可能影响生育能力。
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