男性染色体为46XYq-不一定会有影响。
绝大部分的46XYq-都是多肽性，对生育没有影响。如果检查男方父亲的染色体是正常的，但男方的Y染色体少了一块，就要建议男方最好要做染色体拷贝数的检查，即做CMA检查。观察少了的这块染色体当中有没有丢关键的基因，如果关键的基因掉了，将来就会影响男性胚胎的发育，这对夫妇最好不要生育男孩。
胎停运后，做染色体的检查发现男性的染色体46XYq-的情况解释是：正常男性的染色体是46XY，而男性检查46XYq-就说明此男性的Y染色体短了一块，短的这一块主要是易染色质的丢失。
这种情况下，绝大部分是染色体的多态性，不会影响精子的发育。如果遇到这种情况，最好是让男方的父亲也检查染色体，如果男方父亲和男方是一样的，就可以肯定是多态性。
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