男孩乳头里面长了一个疙瘩并伴有疼痛的原因可能是乳头损伤、乳腺组织增生、乳房感染、皮下脂肪瘤、乳腺纤维瘤等疾病引起的，需针对病因采取相应的治疗措施。
1、乳头损伤：乳头被外界因素如擦伤、撞击或摩擦所损伤，可能导致疼痛和疙瘩的形成，适当休息即可，通常可以自愈，不会造成明显的影响。
2、乳腺组织增生：在青春期男孩的身体发育过程中，体内激素的变化可能导致乳腺组织增生，形成疙瘩。：对于乳腺组织增生引起的疙瘩，通常不需要特殊治疗，因为它们往往是自限性的。但患者要注意保证饮食健康、保持适当的体重。如果疙瘩导致明显的不适或影响生活质量，可以就医咨询医生。
3、乳房感染：细菌感染可以导致乳房组织发炎和疼痛，形成疙瘩。治疗方面主要是使用抗生素。具体的抗生素类型和剂量需要根据医生的建议来确定，常见的抗生素包括头孢菌素类、阿莫西林等。此外，热敷和遵循医生的建议来保持乳房清洁也是重要的治疗措施。
4、皮下脂肪瘤：皮下脂肪瘤是一种良性肿瘤，由皮下脂肪组织过度增生形成。它可能在乳房内部形成一个疙瘩，伴随疼痛感。治疗一般是手术切除，尤其是如果脂肪瘤造成明显不适或增大。
5、乳腺纤维瘤：乳腺纤维瘤是一种常见的乳腺肿瘤，由乳腺的结缔组织增生引起。它可能在乳房中形成一个可触及的疙瘩，有时会伴随轻微的疼痛。治疗取决于症状和病变的性质。小的纤维瘤可能不需要特殊治疗，但如果疼痛严重或增大，可能需要考虑手术切除。
建议就医进行进一步评估和确诊，医生可能会建议进行乳腺超声检查、乳腺钼靶摄影或其他影像学检查来评估疙瘩的性质。
